Το Ταμείο Χρηματοπιστωτικής Σταθερότητας είναι ιεραρχικά δομημένο σε τμήματα με σαφώς καθορισμένα καθήκοντα και αρμοδιότητες.
Η διάρθρωσή του αντανακλά την προσήλωση σε σύγχρονες οργανωτικές αρχές και αποτελεί τη βάση για την επίτευξη των επιχειρηματικών του στόχων.
Επιπλέον, συμβάλλει στην υψηλότερη ολοκλήρωση και τη μέγιστη δυνατή αξιοποίηση πόρων, σε καλύτερη επικοινωνία μεταξύ των τμημάτων, εστίαση της ομάδας σε κοινούς στόχους, ταχύτερη λήψη αποφάσεων σε επίπεδο διευθύνσεων και κοινή επιχειρηματική κουλτούρα, αποφεύγοντας ταυτόχρονα την άστοχη επανάληψη εργασιών, τις επικαλύψεις και τον κίνδυνο εμφάνισης περιστατικών σύγκρουσης συμφερόντων.